fedup:用户定义途径的富集和耗尽的费舍尔测试 源码
̊Fisher的试验üSER-规定的P值athways电子nrichment和d epletion fedup是一个R包,它使用Fisher精确测试来测试用户定义路径的富集和耗尽。 该方法设计用于多种途径注释格式(例如gmt,txt,xlsx),以允许用户对自定义注释进行途径分析。 该软件包还与Cytoscape集成在一起,以提供基于网络的途径可视化,从而增强了结果的可解释性。 内容 入门 系统先决条件 R版本≥4.1 R包: CRAN :openxlsx,tibble,dplyr,data.table,ggplot2,ggthemes,forcats,RColorBrewer Bioc
文件列表
fedup-main.zip
(预估有个55文件)
fedup-main
.github
ISSUE_TEMPLATE
issue_template.md
2KB
.gitignore
7B
workflows
R-CMD-check.yaml
3KB
test-coverage.yaml
1KB
check-bioc.yml
10KB
vignettes
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