元基因组装配 WDL工作流程,用于元基因组装配 Python脚本可在非冗余基因目录和MAGS之间生成映射 WDL工作流程简介 该管道将​​执行; 使用Trim Galore和Kneaddata预处理读取 Megahit的元基因组学组装 基因预测 对重叠群的读取映射 使用MetaBAT2进行元基因组分级 基因组箱的质量评估 分类学分类 用CD-HIT-EST进行基因聚类 读取到基因簇的映射并计算基因计数 用法 要求 该管道使用docker映像 输入参数 工作流所需的所有输入均通过JSON文件提供,并且可以使用通过以下命令生成 java -jar womtool.jar输入工作流.wdl> in