DEA_and_fit:执行差异表达分析拟合结果并对杂交基因表达进行分类 源码
DEA_and_fit 考虑到整个Eukarya遗传补体的变异程度,基因表达模式的跨王国比较不能像比较代表性系统的读取计数矩阵那样简单。 相反,可以将亲本[亲本基因与亲本基因]和杂种[亲本来源的基因拷贝与亲本来源的基因拷贝]的差异表达分析结果相结合,以形成可以在不同王国进行比较的五个表达类别。 简而言之,这些表达类别为: 父母亲差异表达遗传(PEI de):在杂交物中保持父母亲表达偏倚。 父母平等表达继承(PEI eq):平等父母表达被杂种继承。 同源同源表达混合(HEB1):在杂种中失去亲本表达偏见。 同源表达偏倚(HEBi):杂种表达偏倚源于无父母偏倚。 同源同源物表达逆转(
文件列表
DEA_and_fit-master.zip
(预估有个6文件)
DEA_and_fit-master
functions.R
8KB
README.md
5KB
files
HH_p_hylite.G_arboreum_x_raimondii.G_HH_rep2.read.summary.txt
1.94MB
sub_classes_df.txt
1.27MB
HH_p_hylite.G_arboreum_x_raimondii.G_HH_rep1.read.summary.txt
1.94MB
HH_p_hylite.expression.txt
1.94MB
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