dmx HGSOC Dec2020 samples:从2020年12月开始对HGSOC样本进行解复用的代码 源码
dmx-HGSOC-Dec2020-样本 内容 从2020年12月开始对我们的HGSOC样本集运行多路分解管线的代码。多路分解管线使用bcftools,cellSNP和Vireo。 样品 该数据集包含来自4个个体的大量RNA-seq样品: 18431X4 18431X5 18431X6 18431X7 2x合并的单细胞RNA-seq样本,每个样本都包含来自所有4个个体的细胞: 18389X2 18389X3
文件列表
dmx-HGSOC-Dec2020-samples-main.zip
(预估有个54文件)
dmx-HGSOC-Dec2020-samples-main
dmx-HGSOC-Dec2020-samples.Rproj
205B
scripts
step5_run_cellSNP_1000Genomes_18389X2.sh
901B
step5a_run_demuxlet_18389X2.sh
638B
step5_run_cellSNP_1000Genomes_18389X3.sh
901B
step3_genotype_bulk_bcftools_X6X7.sh
1KB
step5_run_cellSNP_1000Genomes_threeUTRs_18389X2.sh
931B
step6_run_vireo_1000Genomes_threeUTRs_18389X3.sh
591B
step6_run_vireo_2bulkX5X7_18389X2.sh
555B
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