快速 fastv是用于从测序数据中识别SARS-CoV-2和其他微生物的超快速工具。 它从FASTQ数据中检测微生物序列,生成JSON报告,并在HTML报告中可视化结果。 该工具可用于检测病毒感染性疾病,例如COVID-19。 该工具支持短读(Illumina,BGI等)和长读(ONT,PacBio等)。 快速浏览内容丰富的报告 示例HTML报告(Illumina): : HTML报告样本(ONT): : 样本JSON报告: : SARS-CoV-2识别快速示例 下载用于测试的FASTQ文件: : 获取fastv并使用以下命令进行测试: # make sure that