最佳采样 确定用于准确估计遗传多样性的最佳样本/位置数量的脚本。 描述 一种用于H e ,H o ,Ar,等位基因检测的脚本(optimal_sampling.R)。 F ST的一个脚本,Jost的D,Cavalli-Sforza和弦距离(differentiation.R)。 这些脚本需要针对每个人群分别运行。 运行脚本之前 脚本的输入文件是GenAlEx格式的excel工作表,就像公用LGM数据集的一个SFI,ASP和AUTH共享一样。 由于基因座等级是根据合并的经验数据集确定的,因此必须创建一个新的Excel表格,其中包含要分析的所有基因座。 即使尚未对人群进行基因分型,也应将其添加为缺失数据。 请注意,从此合并数据集计算出的唯一统计信息是基因座等级。 所有其他统计数据均基于每个人口计算。 需要注意的是人口的名称是硬编码的,应在GenAlEx输入文件完全以下:SL_Adul