Final_Reports:此回购包含使用与wtdbg2组装的Pacbio序列数据从帝王蟹基因组组装获得的结果 源码
帝王蟹基因组大会 PacBio CLR数据,下采样至75%ZMW,与wtdbg2组合 Derrik Gratz,Jonas Grove,Chris Chua,Susan Collins,Cameron Watson 对ZMW进行下采样 以随机方式进行采样的目的是进行下采样,以使特定的读取子集不会有偏差地进行采样。 为此,在读取前75%的数据之前,先对数据文件进行混洗。 使用文件的位大小计算数据百分比,以使下采样的数据集涵盖总起始序列数据的75%。 有关更多信息,请参见DownSamplingReport.MD。 设置Conda环境 conda创建--name红豆conda激活红豆conda配置-添加通道bioconda conda config-添加通道conda-forge conda安装-c bioconda wtdbg 运行wtdbg2(redbean) 用法: wtdbg2 [
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Final_Reports-master
environment.yml
348B
redbean.srun
736B
DownSamplingReport.MD
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