mbgc:多细菌基因组压缩器(MBGC) 源码
MBGC:多细菌基因组压缩器 多细菌基因组压缩器(MBGC)是一种以FASTA(或gzip压缩FASTA)输入格式压缩基因组的工具。 它专为快速高效压缩细菌物种集合而设计。 实现: 支持gz存档作为输入, 保留压缩文件的文件夹结构,以及 每行将DNA流解压缩80个碱基, 也可以处理非细菌类的FASTA。 在Linux上安装 mbgc需要库才能工作(为Debian和Ubuntu示例 )。 以下步骤将创建mbgc可执行文件。 在Linux上, mbgc构建要求安装的cmake版本> = 3.4(使用cmake --version检查): git clone https://github
文件列表
mbgc-master.zip
(预估有个72文件)
mbgc-master
coders
PpmdCoder.cpp
6KB
LzmaCoder.cpp
3KB
LzmaCoder.h
4KB
SymbolsPackingFacility.h
4KB
PropsLibrary.h
554B
VarLenDNACoder.cpp
11KB
VarLenDNACoder.h
3KB
lzma
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