DHRLS:纸DHRLS的代码和数据集 源码
对偶超图正则化最小二乘(DHRLS) DHRLS是一种新颖的计算方法,它利用多核学习和Hypergraph正则化最小二乘来预测疾病与基因之间的关联。 1.代码 1)cka_kernels_weights.p:实现CKA算法的函数; 2)construct_Hypergraphs_knn_weight.p:实现超图拉普拉斯矩阵的函数; 3)DHRLS.p:预测疾病与基因之间的关联 4)fold_10.m:实现十折交叉验证的函数 2.数据集 1)疾病名称和基因名称:分别存储疾病名称和基因名称; 2)gene_disease_Y.mat:存储疾病与基因之间的关联矩阵 由于文件上传的限制,请单击“以获取所有数据 3.Predicting_novel_interactions。 此文件夹包含DHRLS模型对960种疾病的Top50预测结果,包括基因名称预测得分和是否已通过验证
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