MS2Planner:通过迭代数据采集优化基于串联质谱的代谢组学的研究范围 源码
MS2计划器 输入 它使用从convert_to_table生成的特征表和原始信号.mzTab(曲线模式)作为输入。 输出 它以.txt格式输出最佳路径,path_finder.log是日志文件。 跑 python path_finder.py mode infile outfile intensity_threshold intensity_ratio num_path -infile_raw -intensity_accu -win_len -isolation -restriction -delay -min_scan -max_scan 保留时间的单位是秒(秒),质荷比是道尔顿(Da)。 mode : apex或baseline或curve apex模式使用顶点文件并应用路径查找算法来查找最佳路径。 baseline模式只是将保留时间分成几个小窗口,窗口的长度由win_len
文件列表
MS2Planner-master.zip
(预估有个8文件)
MS2Planner-master
path_apex.py
8KB
path_finder.py
8KB
path_curve.py
24KB
test
test_data.tar.gz
81.6MB
README.md
5KB
MS1mzTab.toppas
11KB
path_baseline.py
3KB
.gitignore
8B
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