光子晶体光纤(PCF)具有很多特殊性质,这些性质强烈依赖其具体结构。由于光子晶体光纤制作过程复杂,容易造成各种变形,包括包层气孔的位置偏移或变形等,从而明显影响该光子晶体光纤的性能。选用商品保偏单模光子晶体光纤作为研究对象,改变了环绕中心石英芯的两个大空气孔之一的形状和尺寸。固定气孔尺寸和形状,改变其位置; 再固定其位置,改变一个大气孔的直径; 最后同时改变二者,分析其交叉影响。仿真结果显示当一个气孔变形或偏移后,光子晶体光纤的等效折射率、零色散波长、偏振拍长、导模模场形状等参数均发生变化,说明结构偏差对保偏光子晶体光纤性质有明显影响。