小儿热那亚 热那亚大学与Gaslini儿童医院合作处理新生儿脊髓弥散MRI数据的图像分析管道。 图1显示了我们的图像处理管线的主要特征概述。由于SCT算法已在成人成像中得到验证,因此我们专门针对新生儿扫描定制了每个处理步骤,以便应用和改进dMRI模型(例如DKI)。 我们管道的主要步骤涉及运动校正,分割,椎骨标记,向PAM50地图集配准以及特定ROI中扩散度量的计算。 下图显示了我们的图像处理管道概述的关键功能的概述。 该管道将​​循环遍历位于data文件夹下的所有主题(或仅指定的主题),并且结果将串联到单个csv文件中,其中每一行将对应于一个主题。 文件将输出到data文件夹中。 将输出以下度量: dmri :整个WM,GM和CST段中的所有DTI(FA,MD,AD,RD)和DKI(KFA,MK,AK,RK),在整个切片中平均 依存关系 该管道已在SCT v4.1.0上进行了测试