custom_caiman:用于(后期)CaIman分析的自定义脚本源码

valve_20664 4 0 ZIP 2021-04-04 19:04:14

custom_caiman:用于(后期)CaIman分析的自定义脚本

文件列表

custom_caiman-master.zip (预估有个56文件)

custom_caiman-master

start_VR.bat 62B

run_vr.py 5KB

controller_true_vr.py 12KB

notebooks

.ipynb_checkpoints

Manual_tracking_tool-checkpoint.ipynb 13KB

01_Preprocessing_and_motion_correction-checkpoint.ipynb 9KB

04_Place_cell_detection.ipynb 79KB

03_Component_evaluation.ipynb 12KB

First source extraction.ipynb 7KB

Manual_tracking_tool.ipynb 16KB

02_Source_extraction.ipynb 10KB

02.1_Source_extraction_with_manual_ROIs.ipynb 15KB

01_Preprocessing_and_motion_correction.ipynb 11KB

requirements.txt 3KB

.idea

misc.xml 301B

Caiman.iml 557B

inspectionProfiles

profiles_settings.xml 174B

modules.xml 264B

.gitignore 38B

vcs.xml 180B

custom scripts

pipeline_wrapper.py 46KB

div

dff_ana_plots.py 14KB

plotting.py 5KB

file_manager.py 4KB

post_analysis.py 23KB

standalone_scripts

quick_screen_session_standalone.py 5KB

process_behavior_standalone.py 31KB

multisession_analysis

multisession_singlecell.py 7KB

multisession_registration.py 61KB

multi_file_processing.py 20KB

singlecell.py 8KB

dimensionality_reduction.py 14KB

align_activity.py 6KB

batch_analysis.py 21KB

multisession_alignment.py 7KB

pvc_curves.py 8KB

spatial_information.py 11KB

place_cell_class.py 81KB

manual_selection_gui

gui_without_movie.py 24KB

gui_test.py 9KB

manual_neuron_selection_gui.py 4KB

demo_pipeline_edit.py 14KB

metadata.yaml 6KB

standard_pipeline

place_cell_pipeline.py 59KB

behavior_import.py 42KB

performance_check.py 56KB

preprocess.py 8KB

decoder

neural_decoding_example.py 6KB

LSTM_decoding.py 9KB

bayes_decoding_own_data.py 7KB

glm_position_decoder.py 4KB

metadata_new.yaml 3KB

spike_prediction

spike_prediction.py 8KB

diverse

CaImAn-Tips.md.rst 8KB

Getting_Started.rst 11KB

caiman_helper_backup.py 10KB

rois_Hendrik.py 50KB

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