odp:牛津点图 源码

odp-牛津圆点图 该软件可在基因组装配中创建蛋白质同构的点状图。该软件在Simakov 的点状图上进行了可视化建模 该软件的运作方式: 使用菱形blastp查找相互最佳的蛋白质匹配。 计算每个基因组的 。 使用matplotlib绘制基因组装配图,最佳蛋白质命中数和Da / Db 要求 该软件可能最好在Unix环境中运行。所有开发都是在Ubuntu 18.04.4 LTS上进行的。 Python 您的活动python环境必须是 。此软件在实现。管道中必须在您的路径中可用的特定python软件包是: snakemake matplotlib pandas numpy 如果你有conda我建议conda install snakemake matplotlib pandas numpy ,如果你不知道你是否有所需的软件包。 其他软件 对这些程序的直接调用也必须在您的环境中可用。将来的od