重症监护病房_微生物组_研究 微生物组分析和相关数据。 此回购包含手稿“表征非常早产儿的细菌肠道微生物组”的补充数据。 这包括: 完整的工作流程,从原始读取到分析。 元数据(已标识)。 元数据摘要。 对于上下文,以下是本研究中使用的方法的摘要。 实验室规程 使用Bioline ISOLATE粪便DNA试剂盒进行DNA提取,并与制造商协商进行修改以优化DNA产量。 这包括增加β-巯基乙醇(从0.5%到1%,以增加DNA溶解度并减少二级结构的形成),增加额外的洗涤步骤(以提高纯度)和减少洗脱缓冲液体积(以增加最终DNA浓度)。 对于文库制备,我们使用Index Kit v2 C和Platinum:trade_mark:SuperFi:trade_mark:PCR Master Mix遵循Illumina宏基因组学文库制备方案。 对于测序,我们将MiSeq试剂盒V3与Illumina MiSeq系统结合使用,以785F /