mykrobe:数分钟内抗生素耐药性预测 源码
Mykrobe 文献资料 请参阅以获得文档。 快速开始 安装: bioconda conda install -c bioconda mykrobe 从源pip3 install . && mykrobe panels update_metadata && mykrobe panels update_species all pip3 install . && mykrobe panels update_metadata && mykrobe panels update_species all 或使用奇异性或docker(有关详细信息,请参见Wiki) 在Mtb上运行,生成结果的JSON文件: mykrobe predict my_sample_name tb \ --output out.json \ --format json \ --seq reads.fq.
文件列表
mykrobe:数分钟内抗生素耐药性预测
(预估有个108文件)
MANIFEST.in
61B
Singularity.def
1KB
distance task.ipynb
7KB
benchmark set diff.ipynb
8KB
models.py
17KB
genotyper.py
17KB
variant.py
17KB
tox.ini
352B
LICENSE
1KB
README.md
798B
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