macaque cnv figs:与我们的猕猴CNV论文一起使用的可再现图形的数据和脚本 源码
恒河猴的拷贝数变异的起源和长期模式的数据,代码和图形 作者 格雷格·托马斯 关于 该存储库托管CNV调用和其他数据以及R脚本,以进行分析和可再现的图形生成。 引文 即将到来 内容 每个fig文件夹均包含用于在纸张中生成图形和预渲染图形的代码。 如果更改每个脚本顶部附近的color_plots变量,则大多数图形可以彩色或灰度生成。 这是每个文件夹的描述: 1. counts :此文件夹包含一个脚本,该脚本仅读取和报告日志文件中的CNV计数。 2. data :用于生成纸张图形的所有数据 brandler-cafe-genes.csv :与Brandler等人的数据中的CNV调用重叠的人类基因brandler-cafe-genes.csv ID。 brandler-cnvs.zip等人的CNV呼叫。 (2016)长格式,包含大量信息。 这是用于分析人类CNV的主要文件。 该文件已压缩,因为
文件列表
macaque-cnv-figs:与我们的猕猴CNV论文一起使用的可再现图形的数据和脚本
(预估有个239文件)
macaque-genes-10kb-down.bed
1.25MB
macaque-exons.bed
19.88MB
human-transcripts.bed
7.56MB
human-genes-10kb-up.bed
2.3MB
human-exons.bed
44.72MB
macaque-genes.bed
1.25MB
human-cnvs-to-genes.bed
1.14MB
human-genes-10kb-down.bed
2.3MB
macaque-cnvs-to-transcripts.bed
396KB
human-genes.bed
2.3MB
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