该管道可以分析来自全长单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法的数据。 介绍 该管道是使用构建的, 是一种工作流工具,可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。 它带有docker容器,使安装变得简单,结果可高度重现。 快速开始 一世。 安装 ii。 安装或以实现完整的管道重现性(请参阅 )。 请注意,ramdaq不支持conda。 iii。 自动下载管道并使用单个命令在最小数据集上对其进行测试 nextflow run rikenbit/ramdaq -profile test, < docker> 请检查并启用docker或singularity来为您的本地计算环境设置适当的执行设置。 iv。 开始运行您自己的分析! iv-i。 您可以在不下载参考注释数据的情况下运行ramdaq。 nextflow run rikenbit/ramdaq