amfinder:AMFinder套件包含Python脚本该脚本可从墨迹斑斑的植物根部图片中对菌根结构进行高通量注释以及用于手动管理和生成热图的功能齐全的浏览器
AMFinder 自动菌根查找器(AMFinder)可以使用卷积神经网络基于计算机视觉自动识别和量化墨水染色的根图像上的AM真菌定植和自由基内菌丝结构。 概括 命令行脚本( amf ) 安装说明 amf至少需要Python 3.6 。 以下是使用虚拟环境安装依赖项的典型安装: $ python3.7 -m venv amfenv $ source amfenv/bin/activate (amfenv) $ python -m pip install -r requirements.txt (amfenv) $ deactivate 注意:由于 amf与最新的Keras / Tensorflow版本不兼容。 预测模式 预测植物根图像中的真菌定植或自由基内菌丝结构。 $ amf predict 可用的列出
文件列表
amfinder:AMFinder套件包含Python脚本,该脚本可从墨迹斑斑的植物根部图片中对菌根结构进行高通量注释,以及用于手动管理和生成热图的功能齐全的浏览器
(预估有个142文件)
amf
2KB
CNN1v2.h5
16.32MB
CNN2v1.h5
44.79MB
CNN1v1.h5
16.32MB
Nbenth_Rirregularis_high_magnification.jpg
42.83MB
Nbenth_Rirregularis_flatbed_scanner.jpg
13.03MB
dep_graph.dot
1KB
BROWSER.md
0B
SCRIPTS.md
4KB
INSTALL.md
2KB
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