2021_pms_mt 该存储库包含用于对...的比较分析中使用的脚本。 download_mt_genomes_gc_hist 包含Snakefile是下载与efetch > 700个真菌基因组的MT,使每个MT基因组的GC含量直方图。 GenBank登录号和mt基因组的其他信息位于TSV文件table_mt_genomes.txt 。 转到此目录并运行: snakemake -j 1 --use-conda 下载所有这些文件可能需要一段时间。 您可以尝试调整线程数( -j )以使其更快。 产生两个文件夹: mtgenomes ,其中包含fasta文件中的所有mt基因组,以及mtgenomes_gc_hists和PDF中的GC直方图。 introns_identity R脚本用于对齐内含子并绘制%identity的热图。 内含子序列在文件intron_sequences.tar