欢迎来到布珀 Bpipe提供了一个平台,用于运行大型生物信息学工作,该工作平台由一系列处理阶段(称为“管道”)组成。 2021年1月-新! 发布了! 下载 (Google论坛) Bpipe已发表在! 如果您使用Bpipe,请引用: Sadedin S,Pope B和Oshlack A,Bpipe:用于运行和管理生物信息学管道的工具,生物信息学 为什么是布珀? 许多使用生物信息学数据的人最终都将工作作为外壳程序脚本运行。 尽管这使它们易于运行,但有很多限制。 例如,脚本中途失败时,通常很难说出它们在哪里或为什么失败,甚至从失败的角度重新启动作业也更加困难。 没有自动记录已执行的命令或自动捕获控制台输出,以确保以后可以查看发生了什么。 有时作业会失败一半,留下一半创建的文件,这些文件可能会与好的文件混淆。 修改管道也很耗时且容易出错-添加或删除阶段会在多个位置进行修改,这意味着更改