DeepLncLoc:基于深度学习的lncRNA亚细胞定位预测器 源码
DeepLncLoc 基于深度学习的lncRNA亚细胞定位预测因子 用法 如何训练模型 您可以通过命令打击以非常简单的方式训练模型: python train.py –k 3 –d 64 –s 64 –f 128 –metrics MaF –device“ cuda:0” k是k-mers功能的值。 d是由gensim库训练的k-mer特征向量的维数。 s是子序列数。 f是CNN层中的过滤器编号。 指标是训练过程中的评估指标。 “ MaF”代表宏f1,“ ACC”代表精度,“ MaAUC”代表宏auc,“ MiAUC”代表微auc。 设备是用于构建和训练模型的设备。 对于cpu可以是“ cpu”,对于gpu可以是“ cuda”,对于gpu 0可以是“ cuda:0”。 您也可以使用我们提供的软件包来训练您的模型。 首先,您需要导入软件包。 from model . utils im
文件列表
DeepLncLoc-master.zip
(预估有个12文件)
DeepLncLoc-master
Independent_test_set
test_set.txt
621KB
train.py
1KB
LICENSE.txt
1KB
model
utils.py
9KB
DL_ClassifierModel.py
10KB
metrics.py
6KB
lncRNA_lib.py
2KB
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