体细胞和多能细胞的基因表达谱揭示了参与重编程的新途径

我们调查了胚胎干(ES)细胞,诱导多能干(iPS)细胞和成纤维细胞中的基因表达。 使用Partek软件分析了从Gene Expression Omnibus获得的微阵列表达数据集。 ES细胞,iPS细胞和成纤维细胞的人类基因根据它们的表达水平从低到高排列。 iPS细胞中的基因表达模式与ES细胞中的模式非常相似,成纤维细胞基因的表达水平比iPS和ES细胞的表达水平波动更大。 在iPS和ES细胞中,表达差异显着的基因数量较少。 发现了ES和iPS细胞之间表达水平明显不同的几个基因,包括LEFTY2,DLK1和NLRP2。 四个基因属于成纤维细胞中的低表达类别,而高表达类别出现在ES细胞中,即HESRG,PROM1,NTS和LRRN1。 分析这些基因的表达有助于阐明细胞命运调控的机制并有效获得iPS细胞。