funannotate是用于基因组注释的管道(专门为真菌构建,但也可用于高级真核生物)。 有关安装,使用和更多信息,请参见 最快启动Docker: 您可以使用funannotate运行funannotate 。 需要注意的是,GeneMark不包含在Docker映像中(请参阅下面的许可,您可以向开发人员投诉,因为它难以分发/使用)。 我还编写了一个bash脚本,该脚本可以运行docker映像并自动检测/包括正确的用户/卷绑定。 该docker映像是基于master中的最新代码构建的,因此它将早于标记的发行版。 该映像还包括所需的数据库,如果您只想在没有数据库的情况下进行注解,则该映像位于nextgenusfs/funannotate-slim hub以及nextgenusfs/funannotate-slim 。 因此,可以通过以下方式实现此路线: # download/pull th