电子技术 在单个Pyomo建模框架中构建酶促和热力学约束GEM的脚本。 环境 这些脚本是使用Python 3.5.5编写和测试的。 管道必不可少的核心库包括: Cobrapy工具箱:--0.13.3版本(推荐,因为最新版本已删除了必需的“ convert_to_irreversversible”功能); Pyomo软件包:--5.7版; Gurobi求解器:版本--9.0.2; 此外,还有熊猫和相关包装。 软件 Requirements.txt中列出了用于运行管道的软件包。 要使用pip安装要求,请在命令行上运行以下代码: $ pip install -r requirements.txt 要使用Python 3.5.5和所有必需的软件包版本(尤其是cobrapy也可用)创建名为ETGEMs的独立环境,请运行以下代码: $ conda create -n ETGEMs py