FastMLST::high_voltage::dna:FastMLST 源码

快速MLST 多核多基因座序列分型工具,结合等位基因串联。 介绍 FastMLST是用Python3编写的高速独立脚本,它采用FASTA格式的程序集(也允许压缩),并根据定义的MLST方案确定其ST。 与其他ST确定程序相比,主要优点是FastMLST允许生成FASTA文件,该文件包含所有已分析的基因组的串联等位基因,这些基因组已准备好进行比对并用于系统发育推断。 您可以在我们的阅读有关MLST分析的完整指南。 安装 当前,安装此脚本的唯一方法是使用Conda。 conda config --add channels defaults conda config --add channels conda-forge conda config --add channels bioconda conda install fastmlst 依存关系 预期使用conda进行安装时,所有依赖项都