深度对接非自动化 深度对接(DD)是一种基于深度学习的工具,旨在加速基于对接的虚拟筛选。 使用所选的对接程序,可以筛选比常规对接速度快50倍的广泛化学文库,例如ZINC15(包含13亿个分子)。 有关DD背后流程的更多详细信息,请参阅我们的论文( )。 该存储库提供了运行DD过程所需的所有脚本,配体制备和分子对接(可以通过许多许可和/或免费程序完成)除外。 此版本的DD是非自动化的,因此要求用户使用自己的对接程序和配体制备工具。 如果您使用DD,请引用: Gentile F,Agrawal V,Hingsing M,Ton AT,Ban F,Norinder U等。 深度扩展坞:用于增强基于结构的药物发现的深度学习平台。 ACS Cent Sci 2020:acscentsci.0c00229。 要求 rdkit 张量流> = 1.14.0 大熊猫 麻木 凯拉斯 matplot