bioinformatics_util 草案 该.R包含R中所有常用的数据处理和分析功能。 plot_script 该目录包含示例draft.R的用法,以及R中的绘图/处理脚本。 align.py 该python3脚本用于使用bowtie2,bwa,STAR和hisat2对齐单端/成对的fastq文件。 相应地更改fastqs,alliger和slurm作业详细信息路径的标题。 runMELT.py 此python3脚本用于为目录中的所有.bam文件提交单独的slurm作业 。 tradseq_to_repenrich2.sh 该Shell脚本将处理通过内部排序方法(Devin King TRAD-Seq)生成的以生成输出。 相应地更改表格顶部以供使用。 extract_uml.sh Devin King编写的tradseq_to_repenrich2.sh的支持脚本。 buil