K MWPBS:K MWPBS(Top K最大重量路径约束二分图) 源码
K-MWPBS(Top-K最大重量路径约束二分子图) 先决条件 请安装: python> = 3.6版本Gurobi版本9 networkx版本2.4 命令: python KMWPBS.py uniq_gene_list discover_me_gene_pairs kegg_pathway.gmt kmwpbs_plot_res> kmwpbs_results 输入参数: uniq_gene_list:文件包含在discover_me_gene_pairs中找到的唯一基因列表discover_me_gene_pairs:以第三列作为p值发现互斥基因对(截止值<0.05) kegg
文件列表
K-MWPBS-master.zip
(预估有个23文件)
K-MWPBS-master
dataset
drugpathway
stad
ASTER_24drugs_stad_uniq_gene.txt
5KB
drugpathwayDScoreGenes02_min3.txt
63KB
aster_24drugs_stad_results.txt
128KB
ASTER_24drugs_stad.txt
29KB
brca
drugpathwayDScoreGenes02_min3.txt
63KB
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