赛康 SyConn的重构版本,可基于密集的EM细分数据自动进行突触连接推断。 对于第一个版本,请参见下面或签出分支。 当前功能: 介绍用于处理超体素的类(例如细胞碎片,预测的细胞器,如线粒体,囊泡云等)和团聚的超体素 亚细胞结构的预测,超体素提取和网格生成 (子)细胞区室(脊柱,胸肉和轴突/树突/体)和细胞类型分类,采用多视图和基于骨骼的方法 胶质细胞的鉴定和分离 连接矩阵导出 用于交互式探索的KNOSSOS插件(正在进行中) 如果您在学术项目中使用此代码库的某些部分,请引用相应的出版物。 文献资料 重构版本的文档仍在开发中,可以在找到。 另外,对于API文档,请参考最新的。 对于SyConn v1,请参阅旧。 我们还将在我们的上提供有关SyConn的更多常规信息。 团队 Philipp Schubert,Jonathan Klimesch,Alexandra Rother和J