UWO241-RNA-Seq分析 全球转录组学分析和南极绿色藻类衣藻(Chlamydomonas sp。)中的热激蛋白。 UWO241 差异基因表达(DEG),热图和维恩 使用HISAT2将数十亿个UWO241 RNA-seq读图定位到绿藻组装的基因组(参考基因组:GCA_016618255.1),并使用HTSeq-count v0.11.3对预测的基因模型进行计数。 使用Stringtie v2.1.5从HISAT2创建的SAM / BAM文件生成表达式估计。 Samtools v1.11用于读取和写入SAM和BAM文件中的Illumina RNA-seq比对。 为了创建全局转录组变化特别是HSP基因家族的热图,通过基因长度和测序深度将比对读取的总数归一化,以准确估计表达水平。 将这些标准化的读取计数(RPKM)用作每个基因的表达水平,并通过Ballgown v2.22.0和edge