DPD工具 一些用于DPD计算的结构创建工具,用C ++编写,可加快结构组合的速度。 源代码 isolated_pa​​rallel.cpp 在聚合物中创建被修饰剂包围的mmt血小板。 平行度是通过将平行六面体单元沿轴拆分为亚平行六面体而完成的,其计数为nx ny nz。 尽管该程序即使在nx,ny和nz具有明显各向异性的情况下也可以运行,但这并不是一个很好的情况,因为它可能导致聚合物链的强取向。 在我的笔记本上,完整线程数:41k原子(74至14 s)4可以,100k原子(403至85 s)8可以。 周期性文件 创建由mmt,改性剂和聚合物制成的周期性结构,类似于通过MD研究的结构。 主要用于参数调整。 一些有用的链接