GWAS_Catalog_Pipeline:目标 源码
GWAS目录管道 COMP383 / 483第8组-Geraldine San Ramon,Zain Anwar,Jessie Chen 运行之前可能需要安装的软件包 R脚本包含将安装软件包的代码,但是以防万一,您可能还需要事先安装它。 R:gwasrapidd( ),biomaRt,dplyr 要预先安装它,请在您的环境中运行以下几行R代码: install.packages("remotes") remotes::install_github("ramiromagno/gwasrapidd") install.packages("BiocManager") BiocManager::install("biomaRt") 使用方法(用于测试输入) 使用此命令将存储库克隆到目录中后, git clone https://github.com/zaanwar/GWAS_Catalog_
文件列表
GWAS_Catalog_Pipeline-main.zip
(预估有个14文件)
GWAS_Catalog_Pipeline-main
EFO_Dictionary.py
1KB
Design doc in md
3KB
Filtering_script.py
2KB
API Commands
798B
group8
example_SPrediScan_output.csv
16KB
snptrait_table.csv
32KB
clean_SPrediScan_ID-pheno.csv
2KB
ENSG-ID_phenotype.txt
2KB
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