ps 用于读取,写入,合并和重新映射SNP的工具 :dna: snps致力于成为易于使用且可访问的开源库,以处理基因型数据 特征 输入输出 从具有对象的各种直接面向消费者(DTC)DNA测试源读取原始数据(基因型)文件 读取和写入VCF文件(例如,将转换为VCF) 合并来自不同DNA测试的原始数据文件,从而在此过程中识别出不同的SNP 读取各种格式的数据(例如,文件,字节,使用gzip或zip压缩的数据) 处理多种类型的文件类型,这些文件类型均通过openSNP解析分析进行了验证 构建/装配检测和重新映射 检测SNP的构建/装配(支持构建36、37和38) 在构建/装配体之间重新映射SNP 数据清理 修复了加载SNP时的几个常见问题 根据染色体和位置对SNP进行排序 重复数据删除RSID 男性X和Y染色体非PAR区域中的等位基因去重复 在MT上消除重复等位基因 将PAR SNP分