ConoSorter:大型锥蜗牛转录组/蛋白质组分析程序 开源
ConoSorter是一个高通量的独立程序,可实现正则表达式和配置文件隐马尔可夫模型(pHMM),以根据ER信号,前肽和成熟肽的成熟区域进行大规模鉴定,并将前体肽段分类为基因超家族和分类。原始的下一代转录组或蛋白质组数据。 ConoSorter还会生成一组相关的附加信息(蛋白质序列的频率,长度,半胱氨酸残基的数量,N末端区域的疏水率),并自动搜索ConoServer数据库,以使用户可以评估结果的可靠性和相关性,并有助于鉴定新的肽类超家族和分类。
文件列表
ConoSorter_v1.1.zip
(预估有个24文件)
ConoSorter_v1.1
layout
185KB
test_dna.fasta
505B
Icon
0B
pHMM
6KB
transl
3KB
test_prot.fasta
161B
LICENSE
34KB
regex_d
295KB
models
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