Benchmarking of small RNA seq:小型RNA seq文库制备方案的基准分析工作流程 源码
小RNA序列的对标 小型RNA-seq文库制备方案的基准分析工作流程 样品可在Gene Expression Omnibus上以登录号下载原始的fastq文件。 工作流程最初的修剪和映射是使用bash脚本完成的。 使用R脚本进行图形生成的计数和分析。 整个工作流程都需要从GEO下载样本。 一些R脚本期望工作流中不包含该世代的文件。 此类文件在此处上传到“ src”文件夹中。
文件列表
Benchmarking-of-small-RNA-seq-master.zip
(预估有个57文件)
Benchmarking-of-small-RNA-seq-master
README.md
621B
main.sh
862B
references
hg38-tRNAs.fa
81KB
hsa_mature.fa
196KB
miRXplore.fa
33KB
hairpin_miRXplore.fa
51KB
hsa_hairpin.fa
261KB
environment.yml
3KB
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