tfprofile:此仓库包含用于为TF ChIP seq数据生成配置文件数据集分析它们和训练模型的脚本 源码
tfprofile 此仓库包含用于为TF ChIP seq数据生成配置文件数据集,分析它们和训练模型的脚本。 bw_to_tfr.sh脚本获取basenji和basset示例文件,并使用8号和9号染色体作为验证和测试集为该数据集创建tfrecords的数据集。 fr_bw_to_tfr.sh在已经存在贝母预处理文件(具有床范围)的情况下运行此程序(从子采样数据创建数据集时就是这种情况)。
文件列表
tfprofile-main.zip
(预估有个11文件)
tfprofile-main
loop_fr_bw_to_tfr.sh
323B
bw_to_tfr.sh
2KB
README.md
463B
fr_bw_to_tfr.sh
2KB
bin
basenji_data_read.py
9KB
util.py
2KB
dna_io.py
7KB
create_samplefile.py
2KB
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