CellProfiler RunOnCluster:用于在HPC集群上运行的CellProfiler插件 源码
CellProfiler-RunOnCluster CellProfiler模块,用于将批处理作业提交到运行Slurm的集群。 安装 视窗 提供了Swansea中Sunbird群集具有默认设置的预编译可执行文件。 这些可执行文件要求安装Java Runtime Environment。 例如,您可以从获得一个。 源码安装 在Linux上运行或开发自己的插件时,最直接的方法是将插件源复制到Cellprofiler插件目录中。 按照有关安装CellProfiler说明。 在右侧面板上选择您的操作系统。 一旦安装了CellProfiler,请在Cellprofiler首选项中设置plugins目录。 下载然后将文件复制到您的插件目录中。 在plugins目录中,安装插件的其他要求: python2 -m pip install -r requirements.txt 用法 提交到集群 在
文件列表
CellProfiler-RunOnCluster-master.zip
(预估有个8文件)
CellProfiler-RunOnCluster-master
CPRynner
CPRynner.py
12KB
__init__.py
0B
LICENSE
2KB
requirements.txt
1KB
clusterview.py
18KB
runoncluster.py
16KB
README.md
3KB
test_runoncluster.py
772B
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