snakemake_multiqc:在蛇形设计中使用multiQC的示例 源码
snakemake_multiqc 这是一个简单,可重现的示例,其运行fastqc,然后使用测试fastq文件在Snakemake工作流程中运行multiqc。 要运行该示例,请从工作目录中运行以下命令,并确保在本地系统或蛇形特定的conda环境中的系统上安装了Snakemake: git clone --recursive https://github.com/jakevc/snakemake_multiqc.git cd snakemake_multiqc snakemake --use-conda fastqc和multiqc结果将在data子目录中生成。
文件列表
snakemake_multiqc-master.zip
(预估有个5文件)
snakemake_multiqc-master
.gitmodules
115B
envs
qc.yml
101B
ngs-test-data
README.md
599B
Snakefile
824B
.gitignore
11B
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