HMCan:HMCan是检测癌症样品中组蛋白修饰的工具。 开源
HMCan是基于隐马尔可夫模型的工具,旨在检测癌症ChIP-seq数据中的组蛋白修饰。 它对数据应用了三个校正步骤:拷贝数校正,GC偏差校正和噪声水平校正。 为了运行HMCan,需要一个ChIP-seq目标对齐文件,并控制对齐文件。 还需要一些配置,有关更多信息,请检查README文件。 作者:Haitham Ashoor联系人:Valentina Boeva Institute库里·海瑟姆·阿苏尔国王阿卜杜拉科技大学。
文件列表
HMCan.tar.gz
(预估有个79文件)
HMCan
hmm.h
6KB
logprobs.cpp
2KB
bdsvd.cpp
37KB
Reader.h
1KB
rotations.h
4KB
gammafunc.h
3KB
GC_profile_mm9.cnp
754KB
Parser.cpp
6KB
linreg.cpp
30KB
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