QUASR是编写用于处理和分析来自Illumina,454和Ion Torrent平台的下一代测序(NGS)数据的轻型管道。 尽管最初是为病毒数据编写的,但它具有足够的通用性,可以在任何NGS数据集上使用。 功能包括:重复去除多路分解引物去除质量保证(QA)图形质量控制(QC)共识生成少数变量确定少数变量绘图当前的主要版本是6.X,该版本使用Python3编写。 我用Java重写了7.X,但仍在进行中。 两者都写得尽可能轻巧,因此它们可以在最小的内存需求下在台式机或笔记本电脑以及计算群集上运行。 如果您对QUASR有任何疑问,请通过自述文件中提供的电子邮件地址与我联系。