模数流 Nextflow管道,用于从NCBI SRA下载和处理微生物RNA序列数据 设置 安装 检查的Java 8或更高版本安装使用: java -version 将nextflow下载到当前目录: curl -s https://get.nextflow.io | bash curl -s https://get.nextflow.io | bash 通过运行以下./nextflow run hello测试安装: ./nextflow run hello 安装 为您的数据集准备元数据文件。 使用来获取指定生物的所有元数据。 要附加本地数据,您可以向tsv文件中添加新行,并填写以下各列: Experiment :对于公共数据,这是您的SRX ID。 对于本地数据,应使用标准化的ID命名数据(例如ecoli_0001) LibraryLayout :要么成对或非单 Platfo