example datasets:与RiboViz一起运行的示例数据集 源码
与RiboViz一起运行的示例数据集。 此示例数据集存储库用于在特定数据集上运行核糖体分析管线所需的配置文件和基因组/注释文件。 目的是: 提供特定的示例数据集,供新用户尝试或适应 在riboviz开发团队之间共享最新的经过测试的示例数据集 主riboviz存储库包含有关一般如何运行riboviz的文档。 目录 评论:“如果您的存储库超过1GB,您可能会收到来自GitHub支持的礼貌的电子邮件,要求您减小存储库的大小以将其还原。” 储存库结构是松散的系统发育 该存储库被大致系统地组织为子文件夹,然后每个物种的示例数据集yaml文件位于同一文件夹中,而fasta / gff文件位于子文件夹annotation 。 我们已经将存储库组织到带有王国的顶级文件夹中,然后按属组织(例如/fungi/neurospora , /animalia/homo )。 王国和属名均为小写,
文件列表
example-datasets-master.zip
(预估有个74文件)
example-datasets-master
simulated
mok
contaminants
Sc_rRNA_example.fa
170B
Sc_rRNA_example-fasta_provenance.txt
490B
annotation
Scer_YAL_5genes_w_250utrs.gff3
848B
tiny_2genes_20utrs.fa
120B
tiny_2genes_20utrs.gff3
307B
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