时间适应 TimeAdapt对人口统计学和从纵向种群基因组数据中进行选择进行了联合推断。该推论基于通过随机森林的近似贝叶斯计算。它需要整个基因组数据和有关样品年龄的信息来进行模拟(使用SLiM + pyslim / msprime)。 要求 该代码已经过以下版本的测试: 的Python 3.8.5 scikit-allel 1.3.2 argparse msprime 0.7.4 麻木 pyslim 0.403 scipy 1.5.4 R 3.6.1 argparser 0.6 extraDistr 1.8.11 碳1.3.1 SLiM 3.4 使用conda进行配置 从头开始创建环境: $ conda create -n timeadaptenv python==3.8.5 r-base=3.6.1 $ conda activate timeadaptenv $ pip