雪兰多亚·萨拉曼德源码

judgment_48088 13 0 ZIP 2021-05-11 00:05:46

雪兰多亚·萨拉曼德

文件列表

Shenandoah_Salamander-master.zip (预估有个92文件)

Shenandoah_Salamander-master

models

two_species_comp_sensitivity.txt 6KB

model_abiotic_biotic_narrow.txt 6KB

model_abiotic_biotic_wider.txt 6KB

model_abiotic_noninformative.txt 5KB

temp_med.txt 233B

simple_logistic_narrow.txt 170B

model_null_noninformative.txt 4KB

temp_over_time.txt 241B

simulation_trial.txt 167B

prac.txt 158B

model_weights.txt 18KB

two_species_temp_simulation.txt 3KB

temp_over_time_est.txt 245B

model_biotic.txt 4KB

no_comp_sensitivity.txt 4KB

all_models.txt 15KB

model_abiotic_biotic.txt 6KB

simulation_temp_comp.csv 320KB

model_null.txt 3KB

temperature_over_time.RDS 70B

model_abiotic.txt 4KB

simple_logistic.txt 174B

simple_logistic_wider.txt 172B

ModelOutputs

first_8yrs_out.rda 879KB

first_5yrs_out.rda 1.8MB

first_7yrs_out.rda 1.86MB

first_6yrs_out.rda 1.83MB

README.md 1B

first_9yrs_out.rda 308KB

two_sp_occ_simulation.R 7KB

README.txt 4KB

Code

prior_simulation.R 7KB

EstimateParameters

Temp_RMI_Elev_by_site_year.csv 278KB

sites.csv 7KB

sampling_correlations.R 3KB

ShenSal_ModRuns_weights 2020_09_11.R 27KB

comp_sensitivity.csv 421KB

ShenSal_ModRuns_weights.R 10KB

ShenSal_ModRuns_subset.R 16KB

sensitivity_exploration.R 4KB

ShenSal_ModRuns.R 18KB

model_weights.R 14KB

no_comp_sensitivity.csv 178KB

simulate_temperature_year.R 6KB

sensitivity.R 23KB

logistic_sim.txt 293B

TableCode

PVA metric summary table.R 14KB

FormatData

Format temp and RMI data.R 18KB

Format Data 15 June 2020.R 25KB

Format Lat Long data 16 June 2020.R 2KB

convergence_exploration.R 9KB

EstimatePVA

PVAruns_1MCMC.R 27KB

ShenSal3.sh 526B

PVAruns_1MCMC_AbioticBiotic.R 28KB

ShenSal1_B.sh 641B

ShenSal1_E.sh 396B

ShenSal1_complete.sh 1KB

.Rhistory 0B

ShenSal1.sh 1KB

ShenSal1_D.sh 647B

PVAruns.R 26KB

ShenSal2.sh 542B

ShenSal1_C.sh 647B

ShenSal1_A.sh 641B

ShenSal1_F.sh 631B

FigureCode

Raw survival colonization Pshen.R 4KB

Population size through time.R 11KB

SummarizePVA

ShenSal_PVAsum1.sh 1KB

ShenSal_PVAsum3.sh 469B

PVAsummary.R 11KB

ShenSal_PVAsum2.sh 482B

logistic_exploration.R 4KB

Data

site_by_year_temp.csv 143KB

KnownRangeData_Shen.csv 94KB

sties_temp_aspect_elev.csv 63KB

site_names.csv 3KB

n_sites_per_year.csv 108B

temp_rmi.rda 1.28MB

site_temp_aspect_elev1.csv 44KB

sites_temp_aspect.csv 41KB

n_surv_per_site_mod.csv 6KB

site_aspect.csv 5KB

KnownRangeData_Cin.csv 95KB

formatted_shen_cin_dat.rda 7KB

n_surv_per_site_true.csv 6KB

VisitData.csv 111KB

Functions

N_fun.R 2KB

B_fun.R 4KB

A_fun.R 3KB

AB_fun.R 5KB

README.md 179B

simulation_temp_comp.csv 320KB

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