GMCMC实现几何平行种群MCMC的C库。该库提供一种高效的并行算法,用于处理复杂的几何建模和统计推断任务。用户可以利用这个库在不同的计算环境中实现几何并行MCMC算法,从而显著提升计算效率和精度。
依赖:
必需的:
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BLAS、CBLAS、LAPACK和LAPACKE
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MPI(openMPI 或 MPICH)
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sundials-2.5.0或更高版本
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支持C99和openmp的C编译器
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GNU make 3.81或更高版本
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MATLAB(读取和写入存储在MATLAB文件中的数据)
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HDF5(读取和写入存储在HDF5文件中的数据)
可选的:
- CUnit(只需要编译测试)
编译:
将make.inc.example复制(或符号链接)到make.inc并编辑其中的路径以指向系统上安装库的位置。键入make编译libgmcmc.so,其中包含并行几何总体MCMC算法和相关模型和先验分布。
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