将映射至 Neo4j 图数据库的开源解决方案。
STON,Sbgn TO Neo4j,是一个基于Java的框架,专门用于将SBGN(系统生物学图形符号)中的过程描述(PD)和活动流(AF)语言转换为与Neo4j兼容的面向图形的格式。这个框架在处理代谢、信号传导和基因调控途径时非常有效,提供了一个强大的工具来链接在两个不同PD映射之间的公共进程。
STON1.2使用两组主要库:LibSBGN和Neo4j库。该框架要求Java 1.8环境,且特别适用于Neo4j社区版2.3.1。如果你对Neo4j图数据库的使用有更多兴趣,以下资源可能会对你有帮助:
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