将映射至 Neo4j 图数据库的开源解决方案。

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STON，Sbgn TO Neo4j，是一个基于Java的框架，专门用于将SBGN（系统生物学图形符号）中的过程描述(PD)和活动流(AF)语言转换为与Neo4j兼容的面向图形的格式。这个框架在处理代谢、信号传导和基因调控途径时非常有效，提供了一个强大的工具来链接在两个不同PD映射之间的公共进程。

STON1.2使用两组主要库：LibSBGN和Neo4j库。该框架要求Java 1.8环境，且特别适用于Neo4j社区版2.3.1。如果你对Neo4j图数据库的使用有更多兴趣，以下资源可能会对你有帮助：

了解图数据库Neo4j的基础知识，请访问图数据库Neo4j。
想进一步深入学习，可以参考图数据库neo4j实战，这本书提供了丰富的实战经验。
如果你正在寻找Neo4j图数据库的入门培训资源，建议阅读Neo4j图数据库入门培训。

文件列表

STON1.0.zip (预估有个52文件)

STON1.0

license

gpl-2.0.txt 18KB

STON1.0.jar 29KB

.DS_Store 10KB

STON1.0_lib

org.apache.servicemix.bundles.jline-0.9.94_1.jar 91KB

lucene-core-3.6.2.jar 1.47MB

server-api-2.2.1.jar 117KB

concurrentlinkedhashmap-lru-1.4.jar 114KB

neo4j-lucene-index-2.2.1.jar 234KB

neo4j-import-tool-2.2.1.jar 38KB

org.sbgn.jar 51KB

neo4j-graph-matching-2.2.1.jar 52KB

opencsv-2.3.jar 19KB

neo4j-shell-2.2.1.jar 264KB

neo4j-udc-2.2.1.jar 37KB

neo4j-cypher-compiler-2.1-2.1.7.jar 7.5MB

neo4j-csv-2.2.1.jar 62KB

parboiled-core-1.1.7.jar 182KB

neo4j-primitive-collections-2.2.1.jar 183KB

neo4j-cypher-compiler-1.9-2.0.4.jar 2.9MB

neo4j-cypher-compiler-2.2-2.2.1.jar 9.78MB

neo4j-io-2.2.1.jar 101KB

neo4j-consistency-check-2.2.1.jar 323KB

neo4j-jmx-2.2.1.jar 47KB

parboiled-scala_2.10-1.1.7.jar 232KB

neo4j-unsafe-2.2.1.jar 10KB

neo4j-kernel-2.2.1.jar 3.11MB

neo4j-cypher-2.2.1.jar 623KB

neo4j-graph-algo-2.2.1.jar 160KB

scala-library-2.10.5.jar 6.8MB

neo4j-cypher-compiler-2.0-2.0.4.jar 5.21MB

help

images

warnIcon.png 2KB

open.png 5KB

help.png 10KB

directory.png 61KB

PD_rules.png 154KB

openF.png 37KB

db.png 31KB

global.png 31KB

AF_rules.png 96KB

goT.png 6KB

.DS_Store 6KB

texta.png 30KB

jarfile.png 65KB

file.png 9KB

setdb.png 6KB

dbButton.png 9KB

openButton.png 33KB

errorformat.png 23KB

doc.html 7KB

help.html 5KB

.DS_Store 8KB

about.html 2KB

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