程序员考试刷题

1.背景

什么是外显子分析?简单地说,根据遗传知识,从不太大的数据中找出致病变异。它还需要一些计算技能

外显子组分析需要什么?

  • 遗传学知识:了解目标疾病,尤其是遗传背景相关数据库的知识(如何找到你想要的信息)。

  • 外显子测序/高速测序仪/分子生物学知识

  • 计算技能

  • 道德问题/隐私保护/IF和SF知识。

虽然不是绝对的,但从上到下的顺序变得更加重要。这完全是我有偏见的列表,所以我可以同意3或4或5的反向/更改。

2.目标

这个迷你课程是为讲座而制作的,让您迈出生物信息学分析的第一步。它假定这是为逐步动手风格而制作的,但这可以应用于自学。

不要害怕。如果你失败了,什么都不会发生。没有样品丢失。不浪费任何提示/芯片/凝胶/溶液/酶/抗体。只是积累你的经验。熟能生巧。

本课程将涵盖:

  • 自定义您的Macintosh环境以运行生物信息学程序。

  • 体验简单的目标重测序数据分析。

  • 了解有哪些步骤(对齐、删除重复、变体调用等)。

  • 如何解释变体不覆盖:算法如何工作。

  • 如何使用集群计算机处理海量数据(SSH、Grid Job Scheduler、内存使用、磁盘I)。