琪琪从头宏基因组组装器安装克隆Kiki存储库,确保安装了CMake构建和测试。进入琪琪目录,运行./ki -i ../test/short.fa -o 测试
。处理contig文件的脚本位于kiki/scripts/
。示例1:按长度对contigs进行排序并创建一个包含长度超过1kb的contigs的fasta文件。示例2:将fasta contig文件转换为制表符分隔的格式。
kiki:来自新的宏基因组组装
文件列表
kiki-master.zip
(预估有个33文件)
kiki-master
hash_chain.h
2KB
debug.c
1KB
comm.c
4KB
raiphy.h
1KB
raiphy.c
13KB
hash_oa.h
2KB
comm.h
2KB
hash_oa.c
13KB
mem.c
6KB
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