npg_docker 最后更新:28/10/14 (sd15)。该存储库集中了 Stefan Dang 的安置项目 @ Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton 的各种小型原型。这个为期3个月的项目探索将不同对齐程序/管道封装在 容器 中的可能性,以便在封闭环境中进行生产或用于 Illumina BaseSpace Native Apps。更多详情请参阅 Sanger Informatics Group Meeting 的演讲以获取精美插图。

概述

  • autobuild:用于管理在相同基础映像之上的单独Docker容器内所有必需管道二进制文件的自动构建脚本。与在单一容器中构建所有二进制文件相比,这显著减少了 构建时间可维护性,同时保留了 虚拟化优势(如可预测的环境和数据来源)。

  • basespace-smalt:在单个容器中进行部署。